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http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/7371| Título: | Uma abordagem contínua do problema da geometria de distâncias para reconstrução e alinhamento de proteínas |
| Autor(es): | Souza, Alisson Lucas de |
| Orientador(es): | Martinez, André Luís Machado |
| Palavras-chave: | Geometria Otimização matemática Proteínas Geometry Mathematical optimization Proteins |
| Data do documento: | 2017 |
| Editor: | Universidade Tecnológica Federal do Paraná |
| Câmpus: | Cornelio Procopio |
| Citação: | SOUZA, Alisson Lucas. Uma abordagem contínua do problema da geometria de distâncias para reconstrução e alinhamento de proteínas. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Licenciatura em Matemática) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Cornélio Procópio, 2017. |
| Resumo: | Neste trabalho estudamos conceitos matemáticos preliminares de Álgebra Linear, Hipercomplexos e Otimizacao, relacionados ao Problema da Geometria de Distancias (PGD). A partir destes conceitos, abordamos o PGD para reconstrução de proteínas por meio da aplicação de métodos de otimização contínua. O trabalho, ainda, contempla os estudos do problema Pro-crustes para alinhamento molecular. Apresentamos testes numéricos da resolução do PGD utilizando os métodos de otimização não-linear BFGS e Gauss-Newton, com dados retirados do Protein Data Bank , e discutimos os resultados obtidos. |
| Abstract: | In this work we study preliminary mathematical concepts of Linear Algebra, Hypercomplex and Optimization, related to the Distance Geometry Problem (DGP). From these concepts, we approach PGD for protein reconstruction through the application of continuous optimization methods. The work also contemplates the studies of the problem Procrustes for molecular alignment. We present numerical tests of the resolution of DGP using the non-linear optimization methods BFGS and Gauss-Newton, with data taken from the Protein Data Bank, and we discuss the obtained results. |
| URI: | http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/7371 |
| Aparece nas coleções: | CP - Licenciatura em Matemática |
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