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http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/34333| Título: | Pipeline de ferramentas de Bioinformática para predição de epítopos antigênicos |
| Título(s) alternativo(s): | Pipeline of bioinformatic tools for predicting antigenic epitopes |
| Autor(es): | Gonçalves, Iara Liz Rufato |
| Orientador(es): | Souza, Samara Silva de |
| Palavras-chave: | Bioinformática Imunologia molecular Bibliometria Bioinformatics Molecular immunology Bibliometrics |
| Data do documento: | 4-Abr-2024 |
| Editor: | Universidade Tecnológica Federal do Paraná |
| Câmpus: | Dois Vizinhos |
| Citação: | GONÇALVES, Iara Liz Rufato. Pipeline de ferramentas de Bioinformática para predição de epítopos antigênicos. 2024. Monografia (Especialização em Biologia Molecular) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Dois Vizinhos, 2024. |
| Resumo: | A bioinformática representa uma inovadora intersecção entre ferramentas computacionais e conhecimento biológico. Os programas e plataformas bioinformáticas de livre acesso, juntamente com os bancos de dados biológicos, atuam como facilitadores na dinâmica da pesquisa científica. Permitem a busca, o processamento e a experimentação in silico, diminuindo assim tempo e recurso, além de otimizar resultados. Como cada ferramenta tem particularidades e limitações, faz-se necessário uma referência lógica para padronização do processo. O presente trabalho propõe um pipeline atualizado para a predição de epítopos antigênicos. O estudo oferece um panorama geral do que está disponível ao pesquisador, assim como estabelece um guia prático, elucidando as etapas para obtenção de um epítopo capaz de gerar uma resposta imunológica abrangente e com maior efetividade. São apresentadas oito ferramentas bioinformáticas gratuitas comumente utilizadas e suas especificidades, com base em revisões de literatura e análises estatísticas de frequência de citação em artigos filtrados do PubMed. O pipeline final é composto por quatro ferramentas melhor avaliadas e dentro dos critérios estabelecidos: atualidade, acesso grátis e contexto de aplicação em saúde humana. O resultado é uma alternativa eficiente para reduzir o tempo e os custos no desenvolvimento de imunobiológicos, destacando-se por sua robustez, incluindo etapas críticas de tomada de decisão e uma interface de usuário amigável que integra todas as ferramentas. Este trabalho não apenas fornece uma visão abrangente do panorama atual, mas também identifica perspectivas futuras para o desenvolvimento de vacinas e terapias personalizadas. |
| Abstract: | Bioinformatics represents an innovative intersection between computational tools and biological knowledge, playing a fundamental role in scientific research. This study proposes an updated pipeline for predicting antigenic epitopes, aiming to provide a practical guide for researchers. Eight commonly used free bioinformatics tools, along with their specificities, are presented based on literature reviews and statistical analyses of citation frequency in filtered articles from PubMed.. The final pipeline consists of four top-rated tools meeting established criteria: relevance, free access, and context of application in human health. The result is an efficient alternative to reduce time and costs in the development of immunobiologics, standing out for its robustness, including critical decision-making steps and a user-friendly interface that integrates all tools. This work not only provides a comprehensive overview of the current landscape but also identifies future perspectives for the development of vaccines and personalized therapies. |
| URI: | http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/34333 |
| Aparece nas coleções: | DV - Biologia molecular |
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