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http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/6018| Título: | Integração do HCF-web a herbários virtuais brasileiros |
| Título(s) alternativo(s): | Integration of HCF-Web to virtual herbariums in Brazil |
| Autor(es): | Kajihara, Alexandre Yuji |
| Orientador(es): | Schwerz, André Luís |
| Palavras-chave: | Herbários JavaScript (Linguagem de programação de computador) Computação de alto desempenho Herbaria JavaScript (Computer program language) High performance computing |
| Data do documento: | 2-Jul-2019 |
| Editor: | Universidade Tecnológica Federal do Paraná |
| Câmpus: | Campo Mourao |
| Citação: | KAJIHARA, Alexandre Yuji. Integração do HCF-web a herbários virtuais brasileiros. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Campo Mourão, 2019. |
| Resumo: | O Herbário da Universidade Tecnológica Federal do Paraná, do Campus Campo Mourão, também conhecido como HCF, compartilha sua coleção, por meio de seu sistema web (HCFWeb), com o Herbário Virtual Reflora e o Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia Herbário Virtual da Flora e dos Fungos (INCT-HVFF). Os dois herbários virtuais aceitam sugestõesdereidentificaçãodeamostra,elaboradasporespecialistas. Noentanto,assugestões não são atualizadas automaticamente, no sistema HCF-Web e, portanto, esses dados são comparados manualmente, com equivalentes, nos herbários virtuais. Como o HCF tem mais de 28 mil exsicatas, a identificação de inconsistências exige muito tempo e é passível de erros. Este trabalho apresenta o desenvolvimento de uma extensão web para o HCF-Web, que compara dados aos seus equivalentes nos herbários virtuais, para que divergências possam ser destacadas. Para implementar essa solução, foi utilizada: (i) a API do Reflora, para atualização imediata ou programada; (ii) e um arquivo CSV, criado pelo sistema speciesLink, do INCT-HVFF. Para testar essa abordagem, nove amostras do HCF, variando de 5 mil a 25 mil espécimes, foram selecionadas, aleatoriamente, para validar as funções. Cada amostra foi testadatrêsvezespara: (i)calcularamédiadotempodeexecução, emminutos; (ii)everificar o número de divergências. Também foi coletado o número de falhas, durante a execução da API do Reflora. Como esperado, o tempo para a identificação da divergência variou linearmente, de acordo com o tamanho das amostras. Em relação ao INCT-HVFF, a conexão com a Internet não é necessária para comparar os dados do HCF com os do speciesLink. Portanto, a identificação de divergências é mais rápida que no processo do Reflora. Por fim, as contribuições desta pesquisa são: (i) uma solução para problemas de inconsistência de dados entre o HCF e os herbários virtuais; (ii) aumento da precisão quanto à identificação de divergências; (iii) aprimoramento do fluxo de trabalho do pessoal do HCF, uma vez que a comparação manual de dados, que normalmente leva semanas para ser executada, pode agora ser feita automaticamente, em menor tempo. |
| Abstract: | The Herbarium of the Federal University of Technology - Paraná, on the Campo Mourão Campus, also known as HCF, shares its collection throught its web system (HCF-Web) with the Reflora Virtual Herbarium and the National Institute of Science and Technology Virtual Herbarium of Flora and Fungi (INCT-HVFF). The two virtual herbariums accept suggestions on sample re-identification elaborated by experts. However, suggestions are not automatically updated into the HCF-Web system and, therefore, such data are manually compared with equivalents on virtual herbariums. Since HCF has more than twenty-eight thousand exsiccates, the identification of inconsistencies demands a long time and is errorprone. This work presents the development of an HCF-Web extension that compare data to their equivalents in virtual herbariums so that divergences can be highlighted. In order to implement this solution, it was used: (i) the Reflora’s API for immediate or programmed updating; (ii) and a CSV file created by the speciesLink system from INCT-HVFF. To test this approach, nine HCF samples, ranging from five to twenty-five thousand specimens were randomly selected to validate functions. Each sample was tested three times to: (i) calculate mean execution time, in minutes; (ii) and verify the number of divergences. It was also gathered the number of fails during Reflora’s API execution. As expected, time for the divergence identification varied linearly according to the samples’ size. Regarding the INCT-HVFF, the Internet connection is not required to compare HCF and speciesLink data. Therefore, identification of divergences is faster than in the Reflora process. Finally, this research contributions are: (i) a solution to issues on data inconsistency between HCF and virtual herbariums; (ii) increase in precision concerning the identification of divergences; (iii) enhancment of the workflow of the HCF personnel, since manual data comparison, which usually took weeks to be performed, can now be automatically made in a shorter time. |
| URI: | http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/6018 |
| Aparece nas coleções: | CM - Ciência da Computação |
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