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Título: Mitochondrial defect associated mutation in the DNM1L protein: a review of variants and etiologic analyzes from a database
Título(s) alternativo(s): Mutação associada ao defeito mitocondrial na proteína DNM1L: Uma revisão das variantes e análises etiológicas a partir de um banco de dados
Autor(es): Marins, Lais De Oliveira
Orientador(es): Busso, Cleverson
Palavras-chave: Mitocôndria
Doenças raras
Sistema nervoso - Degeneração
Mitochondria
Rare diseases
Nervous system - Degeneration
Data do documento: 20-Fev-2024
Editor: Universidade Tecnológica Federal do Paraná
Câmpus: Dois Vizinhos
Citação: MARINS, Laís de Oliveira. Mitochondrial defect associated mutation in the DNM1L protein: a review of variants and etiologic analyzes from a database. 2024. Monografia (Especialização em Biologia Molecular) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Dois Vizinhos, 2024.
Resumo: A mitocôndria é uma organela essencial em papéis vitais na manutenção da sobrevivência, viabilidade, integridade celular e funcionalidade celular. A dinamina 1 como (DNM1L) pertence a uma família da proteína, igualmente conhecida como a proteína 1 que codifica a família da dinamina (DRP1) ou a proteína 1 da dinamina (DLP1) que está principalmente no citosol da pilha e participa no recrutamento à membrana mitocondrial exterior pela membranaproteínas receptoras ancoradas, envolvendo fator de fissão mitocondrial (MFF), proteína de fissão mitocondrial 1 (FIS1) e proteínas de dinâmica mitocondrial (MID49 e MID51), esta proteína está envolvida na endocitose mediada pela vesícula endocítica e no equilíbrio de fusão e fissão, que implica mecanismos associados aos peroxissomos. Na hidrólise de GTPases, DNM1L submete-se às mudanças que induzem a constrição da membrana e conduzem subseqüentemente à fissão da vesícula da membrana. O processo de fusão é o principal responsável pela fusão entre as organelas em resposta à formação de complexos de fusão coordenados pelas proteínas Mifusins 1 e 2 ou MFN1 e MFN2 na parte externa da célula e OPA1 na parte interna. A família Dynamin são proteínas reguladoras da atividade em neurônios sinápticos, mantendo a função em organelas, quando afetadas durante a homeostase celular está associada ao desenvolvimento de doenças mitocondriais ligadas a alterações no DNA mitocondrial (mtDNA) ou DNA nuclear (nDNA). A mutação DNM1L é um exemplo disso, seu defeito pode causar fissão ou fusão anormal na vesícula endocítica afetando principalmente a função sináptica neuronal acarretando o desenvolvimento de encefalopatia letal em crianças ou outras doenças neurodegenerativas. Atualmente existem ferramentas utilizadas para realizar o diagnóstico as quais possibilitam identificar com agilidade e exatidão as mutações do mtDNA associados a expressão de DNM1L são utilizados recursos que identificam esse tipo de mutação através de técnicas de diagnóstico genético e análise de imagem através de imunofluorescência, microscopia confocal da exploração do laser, cultura celular, micro-oximetria e Whole Exome Sequencing (WES) permitindo a avaliação do genoma e possíveis alterações celulares, assim como para verificar sua função, podendo revelar o espectro fenotípico em expansão associado às variantes DNM1L. Neste estudo foi desenvolvido através de uma plataforma de bioinformática como principal ferramenta de busca de variantes na base de dados Uniprot utilizando como parâmetro a análise dos resultados obtidos através do gene DNM1L para analisar a importância da interação deste na manutenção regular da saúde celular e suas implicações para as doenças mitocondriais na pesquisa de doenças raras. A etiologia ainda é incerta e apresenta grande variabilidade genética em diversas partes do mundo, porém resultados científicos não foram obtidos no Brasil.
Abstract: Mitochondria is an essential organelle in vital roles in maintaining survival, viability, cell integrity and cellular functionality. Dynamin 1 as (DNM1L) belongs to a protein family, also known as protein 1 coding dynamin family (DRP1) or dynamin protein 1 (DLP1) which is mainly in the cytosol of the cell and participates in recruitment to the outer mitochondrial membrane by anchored receptor membrane protein, involving mitochondrial fission factor (MFF), mitochondrial fission protein 1 (FIS1) and mitochondrial dynamics proteins (MID49 and MID51), this protein is involved in endocytosis mediated by the endocytic vesicle and in the balance of fusion and fission, which implies mechanisms associated with peroxisomes. In GTPases hydrolysis, DNM1L undergoes changes that induce membrane constriction and subsequently lead to membrane vesicle fission. The fusion process is primarily responsible for the fusion between the organelles in response to the formation of fusion complexes coordinated by the proteins Mifusins 1 and 2 or MFN1 and MFN2 on the outside of the cell and OPA1 on the inside. The Dynamin family are proteins regulating activity in synaptic neurons, maintaining function in organelles, when affected during cellular homeostasis is associated with the development of mitochondrial diseases linked to changes in mitochondrial DNA (mtDNA) or nuclear DNA (nDNA).DNM1L mutation is an example of this, its defect can cause abnormal fission or fusion in the endocytic vesicle affecting mainly neuronal synaptic function leading to the development of lethal encephalopathy in children or other neurodegenerative diseases. Currently there are tools used to perform the diagnosis which make it possible to quickly and accurately identify the mtDNA mutations associated with the expression of DNM1L are used resources that identify this type of mutation through diagnostic techniques genetic and image analysis through immunofluorescence, laser scanning confocal microscopy, cell culture, micro-oximetry and Whole Exome Sequencing (WES) allowing evaluation of the genome and possible cellular changes, as well as to verify its function, spectrumassociated with DNM1L variants. In this study it was developed through a bioinformatics platform as the main tool to search for variants in the Uniprot database using the The analysis of the results obtained through the DNM1L gene as a parameter was performed to analyze the importance of the interaction of this protein in the regular maintenance of cellular health and its implications for mitochondrial diseases in the research of rare diseases. The etiology is still uncertain and has great genetic variability in several parts of the world, however scientific results were not obtained in Brazil.
URI: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/34334
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