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http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/34285
Título: | Diversidade de vírus específicos de insetos identificados por sequenciamento de nova geração em culicídeos no Brasil: revisão sistemática de literatura |
Título(s) alternativo(s): | Diversity of Insect Specific Viruses identified by Next Generation Sequencing in culicids of Brazil: systematic literature review |
Autor(es): | Aragao, Carine Fortes |
Orientador(es): | Ghisi, Nédia de Castilhos |
Palavras-chave: | Vírus Sequenciamento de nucleotídeo Insetos Viruses Nucleotide sequence Insects |
Data do documento: | 26-Mar-2024 |
Editor: | Universidade Tecnológica Federal do Paraná |
Câmpus: | Dois Vizinhos |
Citação: | ARAGAO, Carine Fortes. Diversidade de vírus específicos de insetos identificados por sequenciamento de nova geração em culicídeos no Brasil: revisão sistemática de literatura. 2024. Monografia (Especialização em Biologia Molecular) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Dois Vizinhos, 2024. |
Resumo: | Os insetos abrigam uma diversidade de vírus, incluindo espécies virais que afetam a saúde pública e animal (os arbovírus) e vírus específicos de inseto (ISV). Estes últimos são vírus restritos de insetos, mas podem ser úteis para o controle biológico das arboviroses e de insetos-praga. A acessibilidade às tecnologias de Sequenciamento de Nova Geração (NGS) têm proporcionado a descoberta de uma ampla variedade de ISVs, o que não seria possível com uso de métodos clássicos para detecção viral. Neste contexto, a presente revisão de literatura realizou um levantamento da diversidade de ISVs identificados em mosquitos (Diptera: Culicidae) no Brasil com uso de tecnologias de NGS. A busca de estudos foi realizada a partir da coleção do Web of Science (WoS) utilizando-se a seguinte combinação de descritores: “Virome” OR Virom* OR “Virus Discovery” AND “Insect Viruses” OR “Insect Specific Virus” OR “Mosquito Viruses” OR “Mosquito Specific Virus” AND “Culicidae” OR Culicid* OR “Mosquito” OR Mosquit*. Os documentos obtidos foram filtrados utilizando os seguintes filtros: artigo original, língua inglesa, acesso aberto, Brasil e termo “vírus”. Foram utilizadas nesta revisão 18 publicações nas quais foram identificadas 56 espécies de ISVs, sendo 43 novos registros. Em sua maioria, os ISVs identificados apresentavam genoma de RNA de fita simples, associados à família Flaviviridae e táxon Negevirus, e foram predominantes em mosquitos dos gêneros Aedes e Culex. As tecnologias de Sequenciamento Illumina foram as mais utilizadas e em sua maioria foram utilizadas para a descrição do viroma de mosquitos coletados na região Norte do Brasil. Estes achados mostram que a aplicação do NGS na identificação de ISVs que circulam em mosquitos no Brasil tem proporcionado a descrição de muitos vírus outrora desconhecidos, o que contribui com novas informações a respeito da composição da virosfera. |
Abstract: | Insects harbor a diversity of viruses, including viral species that affect public and animal health (arboviruses) and insect-specific viruses (ISV). The latter are viruses restricted to insects but can be useful for the biological control of arboviruses and insect pests. Accessibility to Next Generation Sequencing (NGS) technologies has enabled the discovery of a wide variety of ISVs, which would not be possible using classical methods for viral detection. In this context, the present literature review carried out a survey of the diversity of ISVs identified in mosquitoes (Diptera: Culicidae) in Brazil using NGS technologies. The search for studies was carried out from the Web of Science (WoS) collection using the following combination of descriptors: “Virome” OR Virom* OR “Virus Discovery” AND “Insect Viruses” OR “Insect Specific Virus” OR “Mosquito Viruses” OR “Mosquito Specific Virus” AND “Culicidae” OR Culicid* OR “Mosquito” OR Mosquit*. The documents obtained were filtered using the following filters: original article, English language, open access, Brazil and term “virus”. 18 publications were used in this review, in which 56 species of ISVs were identified, 43 of which were new records. Most of the ISVs identified had a single-stranded RNA genome, associated with the Flaviviridae family and Negevirus taxon, and were predominant in mosquitoes of the genera Aedes and Culex. Illumina Sequencing technologies were the most used and were mostly used to describe the virome of mosquitoes collected in the Northern region of Brazil. These findings show that the application of NGS to identify ISVs circulating in mosquitoes in Brazil has provided the description of many previously unknown viruses, which contributes with new information regarding the composition of the virosphere. |
URI: | http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/34285 |
Aparece nas coleções: | DV - Biologia molecular |
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