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Título: Detecção do RNA do SARS-Cov-2 em efluente urbano: uma abordagem por RT-qPCR e meta-analítica
Título(s) alternativo(s): Detection of SARS-Cov-2 RNA In wastewater: an RT-qPCR and meta-analytical approach
Autor(es): Bendix, André Felipe
Orientador(es): Ghisi, Nédia de Castilhos
Palavras-chave: Águas residuais
Infecção
COVID-19, Pandemia de, 2020-
Epidemias
Sewage
Infection
COVID-19 Pandemic, 2020-
Epidemics
Data do documento: 13-Dez-2023
Editor: Universidade Tecnológica Federal do Paraná
Câmpus: Dois Vizinhos
Citação: BENDIX, André Felipe. Detecção do RNA do SARS-Cov-2 em efluente urbano: uma abordagem por RT-qPCR e meta-analítica. 2023. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Ponta Grossa, 2023.
Resumo: O mundo vivenciou uma pandemia decorrente da COVID-19 durante três anos, apresentando mais de 770 milhões de infectados e resultando um trágico saldo de mais de 6,9 milhões de óbitos. Nos estágios iniciais da pandemia, a saúde pública mundial enfrentou uma luta para compreender, monitorar e conter o SARS-CoV-2. Esses dois estudos se dedicaram à investigação do monitoramento do vírus via águas residuais, objetivando a detecção do seu material genético neste contexto. Além disso, foram explorados fatores inferenciais potenciais que podem impactar essa abordagem, com destaque para a influência da vazão. Nesse contexto, no estudo I foi realizado uma meta-análise onde verificou-se estatisticamente que a vazão de estações de tratamento de esgoto, que atendem até 60 mil habitantes, não podem interferir independentemente de outros fatores na detecção do SARS-CoV-2. No estudo II foi conduzido um monitoramento durante os períodos de auge da segunda e terceira onda da pandemia da COVID-19 na cidade de Dois Vizinhos, situada no estado do Paraná, região sul do Brasil. A detecção nas amostras foi realizada pela técnica de RT-qPCR, buscando os alvos ORF1ab e nucleocapsídeo N, onde observou-se a detecção da presença de partes do RNA antecedendo os picos de ambas as ondas, ressaltando, particularmente, a identificação precoce do ápice da terceira onda, onde o material genético do vírus foi identificado com 29 dias de antecedência. Nesses estudos ficou claro que a união de fatores como a densidade populacional e número de infectados interferiram na detecção.
Abstract: The world experienced a COVID-19 pandemic for three years, with over 770 million infections and a tragic toll of more than 6.9 million deaths. In the early stages of the pandemic, global public health faced a struggle to comprehend, monitor, and contain the SARS-CoV-2 virus. These two studies focused on investigating virus scanning through wastewater, aiming to detect its genetic material in this context. Additionally, potential inferential factors that could impact this approach were explored, particularly emphasizing the influence of flow rate. In Study I, a meta-analysis was conducted, revealing statistically that the flow rates of sewage treatment plants serving up to 60,000 inhabitants cannot independently interfere with the detection of SARS-CoV-2, regardless of other factors. Study II involved monitoring during the peaks of the second and third waves of the COVID-19 pandemic in Dois Vizinhos, located in Paraná, southern Brazil. The samples were detected using the RT-qPCR technique, targeting the ORF1ab and nucleocapsid N regions. The Study observed the detection of RNA fragments preceding the peaks of both waves, particularly highlighting the early identification of the apex of the third wave, where the virus's genetic material was identified 29 days in advance. These studies underscored that factors such as population density and the number of infections played a role in the detection process.
URI: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/34287
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