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http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/34255| Título: | Análise dos genótipos do vírus dengue no estado do Pará nos anos de 2021 e 2022 |
| Título(s) alternativo(s): | Analysis of dengue virus genotypes in the state of Pará in the years 2021 and 2022 |
| Autor(es): | Borges, Gleissy Adriane Lima |
| Orientador(es): | Frata, Marcela Tostes |
| Palavras-chave: | Vírus da dengue Genes Sequenciamento de nucleotídeo Dengue viruses Genes Nucleotide sequence |
| Data do documento: | 26-Mar-2024 |
| Editor: | Universidade Tecnológica Federal do Paraná |
| Câmpus: | Dois Vizinhos |
| Citação: | BORGES, Gleissy Adriane Lima. Análise dos genótipos do vírus dengue no estado do Pará nos anos de 2021 e 2022. 2024. Monografia (Especialização em Biologia Molecular) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Dois Vizinhos, 2024. |
| Resumo: | A dengue é endêmica em vários continentes, seu agente biológico pode ser transmitido por vetores que apresentam adaptações facilitadas em ambientes de zona tropicais e subtropicais, oferecendo à população susceptível um risco aumentado de rápida disseminação de doenças de impacto sócio econômico. Os sinais e sintomas clínicos são extremamente semelhantes no início da infecção, e os testes disponíveis para o diagnóstico precisam ser cada vez mais sensíveis e específicos. Com a evolução das técnicas de sequenciamento genético, procura-se cada vez mais caracterizar e identificar os diferentes sorotipos e genótipos do vírus dengue. Os estudos no estado do Pará são poucos ou inexistentes quanto aos genótipos mais recentes que circularam nos últimos anos, portanto com acesso a novas tecnologias, almejou-se nesta pesquisa alcançar a análise geral das características moleculares além da filogenia do vírus dengue no estado do Pará entre os anos de 2021 e 2022, a partir de amostras provenientes da rede de diagnóstico da vigilância laboratorial nacional, como amostragem dos 144 municípios atendidos pelo laboratório central do estado. As amostras analisadas pela metodologia de RT-PCR em tempo real e sequenciamento genético de nova geração totalizaram 139 amostras, 28 avaliadas foram do ano de 2021 e 111 do ano de 2022. Baseados em qualidade do genoma obtido, 14 amostras do ano de 2021 foram analisadas no estudo e 52 amostras do ano de 2022. O percentual de municípios demandantes de amostras biológicas e contemplados no estudo foi de 19,44 %. A faixa etária prevalente foi entre 19 a 45 anos e para o sexo feminino. Exclui-se 73 amostras para as avaliações dos dados genômicos. As análises realizadas através do sequenciamento completo do genoma para o vírus dengue concordaram em 100 % com a metodologia de RT-qPCR desenvolvida na rotina diagnóstica do laboratório de saúde pública. O sorotipo 1 foi o prevalente e o genótipo V foi identificado a partir dos estudos de divergência do gene E em 100 % das amostras avaliadas. Observou-se a constante reintrodução do sorotipo 1 (genótipo V) no estado do Pará que corroboram com os estudos em diversas regiões em diferentes períodos no Brasil. Desta forma alerta-se para a reintrodução de um segundo genótipo ou sorotipo não circulante nos últimos anos, possibilitando o surgimento de epidemias em regiões endêmicas e aumento no número de casos. |
| Abstract: | Dengue is endemic on several continents, its biological agent can be transmitted by vectors that have easy adaptations in tropical and subtropical environments, offering the susceptible population an increased risk of rapid dissemination of diseases with socio-economic impact. The clinical signs and symptoms are extremely similar at the beginning of the infection, and the tests available for diagnosis need to be increasingly sensitive and specific. With the evolution of genetic sequencing techniques, there is an increasing attempt to characterize and identify the different serotypes and genotypes of the dengue virus. Studies in the state of Pará are few or non-existent regarding the most recent genotypes that have circulated in recente years, therefore with access to new technologies, the aim of this research was to achieve a general analysis of the molecular characteristics in addition to the phylogeny of the dengue virus in the state of Pará between 2021 and 2022, based on samples from the national laboratory surveillance diagnostic network, as a sample of the 144 municipalities served by the state's central laboratory. The samples analyzed by the real-time RT-PCR methodology and new generation genetic sequencing totaled 139 samples, 28 evaluated were from the year 2021 and 111 from the year 2022. Based on the quality of the genome obtained, 14 samples from the year 2021 were analyzed in the study and 52 samples from the year 2022. The percentage of municipalities requiring biological samples and included in the study was 19.44%. The prevalent age group was between 19 and 45 years old and for females. 73 samples are excluded for genomic data evaluations. The analyzes carried out through complete genome sequencing for the dengue virus agreed 100% with the RT-qPCR methodology developed in the public health laboratory's diagnostic routine. Serotype 1 was the prevalent one and genotype V was identified based on divergence studies of the E gene in 100% of the samples evaluated. The constant reintroduction of serotype 1 (genotype V) was observed in the state of Pará, which corroborates studies in different regions at different periods in Brazil. This raises awareness of the reintroduction of a second genotype or serotype that has not been circulating in recent years, enabling the emergence of epidemics in endemic regions and an increase in the number of cases. |
| URI: | http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/34255 |
| Aparece nas coleções: | DV - Biologia molecular |
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